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首先可以确认的是，通过中、日、韩基因数据库研究表明，这三个东亚群体的祖先同处一源，只不过日本人和中国人之间的相貌差异要大于韩国人与汉族人之间的相貌差异，之所以三者出现相貌差异，主要原因是历史上东亚人产生迁徙分支后，由各自所在的地理环境，经过几千年的繁衍，最终促生出了相貌区别。这三个群体与时间最接近的共同祖先之间，最近可以追朔到3000--3600年，大概处在我国商朝时期，换句话讲就是商朝往后，迁徙到朝鲜半岛、日本岛的黄种人与汉族人逐渐产生了相貌差异。
我国虽然少数民族众多，但大多数汉族人的根源都可以追溯到我国中北部，历史上人种受到过蒙古、中东以及俄罗斯等民族影响，尤其受蒙古人种影响最大，毕竟我国历史上几次胡人入侵，基本都是中北部游牧民族南下，因此我国汉族人外观上中和了一些蒙古人种的特征。而韩国人，亚洲科学界普遍认为，韩国人的起源除了有中国北部少数民族作为主体外，还有部分华南人以及台湾原住民的基因。至于日本人，除了与中国、韩国一样的祖先外，还有一部分来自东南亚、印度尼西亚的基因，不过年代比较久远，后期日本也实行过长时间的闭关锁国，这期间几乎再没有大规模外来人口迁徙进入。
当然了，中、日、韩三国人的面貌是黄种人中区别最小的，这一点与蒙古人种、东南亚人种都有很大不同，可能除了中、日、韩自身能看出三国面貌有细微差别外，其他地区对这三者都是傻傻分不清楚。对了，千万不要被日韩电视剧中的那些漂亮演员所迷惑，尤其是韩国欧巴、韩国美女，他们的脸部天然的没有几个，根本代表不了整个国家群体面貌，实际上这两个国家普通人的面貌长相也很一般，个人认为，赶不上我们。
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1、亚洲
人口：45.96亿人
占世界人口比例：(59.9%)
2、非洲
人口：12.76亿人
占世界人口比例：(16.6%)
3、欧洲
人口：7.33亿人
占世界人口比例：(9.6%)
4、南美洲(拉丁美洲)
人口：6.46亿人
占世界人口比例：(8.4%)
5、北美洲(美国及加拿大)
人口：3.83亿人
占世界人口比例：(5.0%)
6、大洋洲
人口：0.40亿人
占世界人口比例：(0.5%)
7、南极洲(无固定居民)
要回答好题主的问题，首先要廓清一下相关的概念：其一，需要合并同类项，把同一民族的朝鲜人和韩国人合并为“朝鲜半岛人”，与“日本列岛人”对举；其二是“最初”，它不是指人类之初，而是指半岛与列岛两大区域主体人群出现的时候。然后，我们来回答问题：朝鲜半岛人与日本列岛人都是多源头的，但是有部分重合——只能说重合部分的人是同根同源的了。具体情况，小牛做简要汇报。
一、从历史考古成果看，朝鲜半岛人的祖先以新罗人、百济人为主，结合了高句丽人和先期到来的箕子朝鲜人；日本列岛人的祖先有两大来源——最早的绳文人和稍晚的弥生人。商末周初，箕子率领5000族人东去，在朝鲜半岛北部建立了箕子朝鲜。在此之前，在半岛南部还生活着三韩部落，这个族群的人后来分别建立了新罗和百济两个国家。魏晋南北朝时期，中国东北少数民族高句丽人进入半岛，后来将国都设在平壤。唐高宗消灭高句丽后，受到唐朝支持的新罗乘机占领了百济和高句丽在半岛上的土地，建立起朝鲜历史上第一个统一国家，在此基础上，后来逐步形成了朝鲜民族。由此来推断，朝鲜半岛人的族源呈三个方向：既有本土固有的三韩人，也有高句丽所属的夫余人，还有由中国内陆而来的中原人。
关于日本列岛民族的起源，著名史学家樋口隆康的观点较有权威性：有5条线路——北方线路、朝鲜线路、东海线路、冲绳线路和南洋线路。其他史家也基本接受他的观点，尤其赞同其前三条路线。简而言之，日本列岛人的祖先是绳文人和弥生人。绳文人大约是在3.8万至1.8万年前沿着北方陆桥南下列岛的，那时候，萨哈林岛北与勘察加半岛、南与日本列岛是连为一体的。大约三千年前，弥生人由朝鲜半岛等地渡海而来，移居日本列岛，他们也因此被称为“渡来人”。他们当中也有从中国而来的，比如徐福等人。久而久之，绳文人与弥生人融合成一个民族——大和民族，也就是日本列岛的主体民族。
由此看，日本列岛弥生人与朝鲜半岛人应该有较大的重合度，而绳文人的重合度则小得多。
二、从分子人类学的数据看，朝鲜半岛人与日本列岛人在Y染方面都呈现出多样性，多样之中有同一，但比例不占多数。研究父系Y染色体单倍群，有助于人们来探究族源。父系Y染就像一把钥匙，打开打开大门，引导人们寻找发现族群的来龙去脉，因为历经多少年多少代，留存于男儿机体的那小小的Y染几乎是一成不变的。
朝鲜半岛人的Y染是多种多样的，包括C、D、O、N和R等各系。其中以O1b2(原O2b）为底座基因，占比接近40%。拥有这种Y染的群体，大约在1.5万年前由华南北上，他们的语言也就成了后来朝鲜语的基础。O3a5和O3*人群小批量地从大陆而来，占比超过35%，但基本没有参与朝鲜语的构建。C系和D系人群加在一起，大概占到总人数的10%。此外，还有N系、R系和其他O系的人群。
日本列岛人的Y染则呈现出不同的格局：来自于绳文人的D系人口占比达35%，日本古代四大家族的源平橘就是属于D系的分支D1b1a2b1a1；而朝鲜半岛人的D系占比在3%左右。O1b2占比30%，这群人大多是从朝鲜半岛来的，日本四大家族中的藤原氏即属此系。其他的O系估计主要从中国大陆而来，占比达20%。日本列岛人口中有10%的C系人群，但其中有一半是日本特有的C1a1；而朝鲜半岛的C系人口以CTS2657居多。
简单地估算一下，朝鲜半岛人与日本列岛人同根同源的比例很难超过45%。
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